De Havekes Mölle is gebouwd in 1898 in opdracht van de familie Havekes. Op de plaats van de huidige molen stond al midden 14e eeuw een standerdmolen die hoorde bij het landgoed Duistervoorde.

Op 17 augustus 1830 kocht Jan Havekes deze standerdmolen voor 11.020 gulden van de toenmalige eigenaar van landgoed Duistervoorde, wijnhandelaar Johan Carl Goldenberg ...